L'interface de Yahoo! Desktop Search, relativement facile à utiliser, ressemble à l'explorateur de Windows. En dessous d’un premier niveau d’onglets semblable à un programme Windows, se trouve un second niveau représentant la catégorie de fichier dans laquelle on désire trouver le document recherché (emails, pièces jointes, images, musique, ou tous les fichiers confondues, …). Dans chacune des catégories, le Yahoo! Desktop Search ajoute des fonctionnalités additionnelles spécifiques afin d’affiner la recherche et optimiser ses résultats.
Les résultats des recherches s’affichent sur dans la fenêtre de gauche sous forme d’un explorateur Windows avec des informations supplémentaires sur les fichiers - types de fichiers, taille du fichier, date de dernière modification et le chemin d’accès au fichier (path).
La fenêtre à droite permet de prévisualiser les fichiers de la liste de résultats. Pour les fichiers audio et vidéo, un mini media player permet à l’utilisateur d’écouter et/ou de voir le fichier directement à partir de Yahoo! Desktop Search. Dans cette fenêtre de prévisualisation, on peut également trouver des onglets permettant d’effectuer une action sur le résultat sélectionné : Open a file, open an email, forward an email, print a document, etc.
Une fonctionnalité efficace est la mise en évidence des termes de la recherche (surlignage) dans la liste des résultats et dans la fenêtre de prévisualisation.